تعیین جنسیت گونۀ گرگ (Canis lupus) و سگ (Canis lupus familiaris) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره کروموزوم Y

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 گروه محیط زیست، دانشکدۀ منابع طبیعی، دانشگاه تهران

2 گروه محیط زیست، دانشکدۀ منابع طبیعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

3 گروه شیلات، دانشکدۀ منابع طبیعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

چکیده

 
گوشتخواران بزرگ‌جثه از‌جمله گونه‏های جنس Canis از عناصر مهم و تکمیل‌کنندۀ زنجیرۀ ‏غذایی اکوسیستم‏ها هستند. با توجه به کاهش شدید این گونه‏ها در بیشتر زیستگاه‏های طبیعی در سطح کشور، اجرای برنامه‏های حفاظتی در این راستا ضروری است. به‌دلیل جمعیت کم و مشکلات نمونه‏برداری مستقیم، به‌ویژه برای گونه‏های وحشی معمولاً نمونه‏‏ها به‌صورت غیرمستقیم به دست می‏آیند (از قبیل مدفوع یا مو) که در اغلب موارد جنسیت این نمونه‏ها نامشخص است. در این مطالعه با به‌کارگیری نشانگر‏های ریزماهوارۀ کروموزوم Y، تعیین جنسیت نمونه‏های گرگ و سگ انجام شد و از نشانگر ناحیۀ (D-LOOP) ژنوم میتوکندری به‌منزلۀ کنترل برای افزایش دقت آزمایش استفاده شد. براساس تشکیل شدن یا نشدن باند در دو جایگاه ریزماهواره ویژۀ کروموزوم Y جنسیت افراد تعیین شد. تعیین جنسیت نمونه‏های گرگ به‌دست‌آمده یکی از عوامل اساسی در اجرای برنامه‏های حفاظتی محسوب می‏شود و به‌کارگیری کروموزوم‏های جنسی، ابزاری مفید برای تعیین جنسیت در مطالعات مربوط به مدیریت و حفاظت حیات وحش محسوب می‏شود.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Genetic sex determination in two species of wolf (Canis lupus) and dog (Canis lupus familiaris) using Y chromosome microsatellite markers

نویسندگان [English]

  • Marzieh Asadi Aghbolaghi1 1
  • Mohammad Kaboli 1
  • Hamidreza Rezaei 2
  • Ali Shabani 3
1 Department of Environmental Sciences, Faculty of Natural Resources, University of Tehran, Tehran, Iran
2 Department of Environmental Sciences, Faculty of Natural Resources, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Gorgan, Iran
3 Department of Fishery, Faculty of Natural Resources, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Gorgan, Iran
چکیده [English]

Large carnivores, such as the wolf (Canis lupus), play several important ecological roles in their ecosystems. Due to a number of serious threats, wolf populations are undergoing rapid declines in Iran, indicating the necessity of conservation actions for species' survival. The genetic structure of populations is one of the important questions still remaining to wolf management. Due to serious problems in direct sampling, researchers prefer to obtain their genetic samples indirectly from feces or hair, which hampers sex determination. This study using microsatellite markers in the Y chromosome determines the sex of sampled wolves and dogs. In the present study, the control region of mitochondrial DNA (D-LOOP) markers was used as controls to increase the accuracy of the tests. Sex was determined according to whether bands were formed or not in the Y chromosome in two special Microsatellites. This method of sex determination using the sex chromosomes is a useful tool in studies related to wildlife management and conservation.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Wolf
  • Canis
  • microsatellite Y chromosome
  • determine the gender

 

 

Asadi, A.M.2012. Gene flow between wolf and dog using mitochondrial DNA (mtDNA) and Y chromosome microsatellite (SSRs) markers in Hamedan Province. Faculty Natural Resources. Thesis MSc.Tehran University. 100 p. ) in Persian.(

 

Christen, L.W., Stewart, W.B., Bruce, W.B.Genetic methods improve accuracy of gender determination in beavers. Journal of Mammalogy. 2004.85.6:1145–1148.

 

Frankham R: Genetics and extinction. Biological Conservation. 2005.126. 131–140.

 

Godinho, R,. Llaneza, L,. Blanco, J.C,. Lopes, S,. Álvares, F,. García, E.J., Palacios, V,. Cortes, Y,. Talegon, J., Ferrand, N. Genetic evidence for multiple events of hybridization between wolves and domestic dogs in the Iberian Peninsula. Molecular Ecology. 2011. 20, 5154-5166.

 

Hellborg, L., Ellegren, H. Low levels of nucleotide diversity in mammalian Y chromosomes. Molecular Biology and Evolution. 2004: 2.11. 158–163.

 

Koblmuller, S., Nord, M., Wayne, R., Leonard, J.Origin and status of the Great Lakes wolf. Molecular Ecology. 2009.18. 2313–2326.

 

Kariya, T., Igarashi, M., Wada, K., Burkanov, V., Koyama, S., Hoshino, H., Oshida, T. Lack of sequence variation of Y chromosome-linked loci in Steller’s sea lions (Eumetopias jubatus) from Iony Island and the Kuril Islands. Mammalogical Society of Japan. 2009.34: 33–36.

 

Lacolina, L., Scandura, M., Gazzola, A., Cappai, N., Claudia, C., Mattioli, L., Vercillo, F., Apollonio, M.Y-chromosome microsatellite variation in Italian wolves: Acontribution to the study of wolf-dog. Mammalian Biology. 2010.75. 341–347.

 

Mech, L.D., Boitani, L. Wolf social ecology. In: wolves behavior, ecology and conservation. University of Chicago press, Chicago. Illinois. 2003. pp. 472.

Nishida, S., Goto, M.., Pastene, L., Kanda, N., Koike, H. Phylogenetic Relationships Among Cetaceans Revealed by Y-Chromosome Sequences. Zoological Science. 2007. 24. 723–732.

 

Olivier, M.., Lust, G. Two DNA sequences specific for the canine Ychromosome. Animal Genetics. 1998. 29: 146 -14.

 

Olivier, M., Breen, M.., Binns M., Lust, G. Localization and characterization of nucleotide sequences from the canine Y chromosome. Chromosome Research. 1999. 7. 223-233.

 

Rutledge, L., Garroway, C., Loveless, K., Patterson, B. Genetic differentiation of eastern wolves in Algonquin Park despite bridging gene flow between coyotes and grey wolves. Heredity. 2010. 1-12.

 

Scandura, M. The use of microsatellites in the study of social structure in large mammals: Italian wolf and fallow deer as case studies.University of Bielefeld, Faculty of. 2004.pp:135.

 

Scandura, M. Individual sexing and genotyping from blood spots on the snow: A reliable source of DNA for non-invasive genetic surveys. Conservation Genetics. 2005. 6:871–874.

 

Seddon, J.M. Canid-specific primers for molecular sexing using tissue or non-invasive samples. Conservation Genetics. 2005. 6: 147–149.

 

Sugimoto, T., Nagata, J., Aramilev, V., Belozor, A., Higashi1, S., McCullough, D. Species and sex identification from faecal samples of sympatric carnivores, Amur leopard and Siberian tiger, in the Russian Far East. 2006. 7:799–802.

 

Sundqvist, A.K., Ellegren, H., Olivier, M., Vila, C. Y chromosome haplotyping in scandinavian wolves (Canis lupus) based on microsatellite markers. Molecular Ecology. 2001. 10. 1959–1966.

Sundqvist, A.K., Bjomerfeldet, S., Leonard, J., Hailer, F., Hedhammar, A., Ellegre, H.,Vila, C. Unequal Contribution of Sexes in the Origin of Dog Breeds. Genetics. 2006. 172. 1121–1128.

 

Ziaei, H. A Field Guide to the Mammals of Iran. Tehran: Iran Wildlife Center.2009. 420 p). in Persian.(